而在内外城又另设金吾左右卫，金吾左右卫各辖左右街使和五城兵马司，他们的主要职责就是城市内的治安管理，同时担负城管、消防这样的职责，掌京城日夜巡查警戒，还承担一部份皇帝出行护驾的职责。
这个权力还是比较大的，主管京城日夜巡警，同时随行护驾。
左金吾卫掌外城巡警，右金吾卫掌内城巡警，内外城各街道，设立金吾街铺，里面是固定当班值守的金吾铺兵，他们归内外五城兵马司管。
还有内外城左右街使，他们统领的则是巡警骑兵，负责日夜巡逻街道，若遇警事，迅速集结出动。
羽林卫在白塔山设置五门信炮，信炮主要用于京城暴乱、敌情、火灾、爆炸等情况的通知，若白塔发炮，则设置在内外九门的信炮亦齐鸣，驻防羽林卫闻炮声后，就要立即分区集合待命，等待皇帝指示。
而京师内外城还有另一套钟鼓楼信号系统，这套系统则由金吾卫管理，城内的一般警讯，金吾卫通过钟鼓楼的旗鼓与各街铺等联系指挥。
至于皇城和宫城的侍卫警戒，朱以海则是由千牛卫和内四卫负责，千牛卫分左右卫，轮流交替宿卫皇城、宫城，负责执守宫门以及护驾左右。
千牛卫侍从左右卫，还守卫京城外围北面。
而内四卫也是护驾左右，宿卫宫禁，负责皇室安全。
另外还有御前侍卫处，为皇帝御前侍卫武官，俗称的大内高手，带刀侍卫。
另设旗手处，负责执掌御驾所用的金鼓、旗帜，充当仪仗。
侍卫处和旗手处数量都不多，各两营千人。
内四卫则是十营共五千。
羽林军、金吾军、千牛军各两卫，但各军互不统属，同时军下两卫也是互不统属。
内四卫也是分成四卫，互不统属的。
这些部队加起来约五万来人，禁卫三军六卫，实际每卫只有御营一镇的一半左右，但级别与御营一镇提督同级。
在京畿地区，同时也还驻有京营一镇，另御营三镇，这四镇每镇一万五，分驻蓟州、昌平、涿州、通州，处京城外围四面。
这些禁卫部队，大体分为南北衙禁军，京城的北衙禁军十卫，外围的南衙禁军四镇，总共约十二万左右。
搞的这么复杂，当然还是为了安全。
皇帝先排除了太监领军、监军。
朱以海并没有放弃禁军的控制权，北衙十卫提督，南衙四镇提督，加上侍卫处提督、旗手处提督，总共十六个提督，全都直接听令于朱以海，内阁、兵部、五军都督府、总理处都不能直接调动这些将领兵马。
这些兵马之外的军队，兵部掌兵符握调兵权，五军都督府分掌统兵权，皇帝是发兵、选将权。
各省地方上，总督巡抚和省营提督掌省巡防警备营、屯镇，御营提督掌御营军。
但京畿的这十二万人马，皇帝直接掌握。
这各路人马，职责各不同。
羽林军主要是守卫城墙、城门，以及城外，金吾卫主要是负责城内治安、警戒等。
千牛卫是负责皇宫宿卫为主。
内四卫是侍从侍卫、随驾为主。
各部互不编属的情况下，就算成为一镇提督，但想因此兵变造反，或者说借此左右朝政，几乎不可能。
外围的四镇，既可守卫京城外围，特别是北面长城一线，同时还能对京城的这些北衙禁军形成威慑牵制，万一真有人作乱，也能第一时间回师京城平乱。
所有这些部队，大约十二万人，全都由皇帝直接指挥，朱以海相当于京畿卫戍部队总司令。
锦衣卫、东厂这些不再承担宿卫、侍从这些亲军职能，而是只专注于情报、监察这块了。
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